轉座子轉座時能夠導致基因序列的缺失、重復或插入；轉座子通過宿主重組系統(tǒng)導致基因重排。
FB元件兩端為反向重復序列，而copia兩端為同向重復序列。
反轉錄轉座子是指通過RNA實現轉座的遺傳元件。反轉錄病毒是由一列反轉錄轉座子構成含RNA基因組的侵染顆粒。
（1）同向重復之間發(fā)生重組會導致重復序列間的序列缺失； （2）反向重復間的重組會使重復序列間的序列倒位。
在復制轉座中會形成一個共整合中間體，其中含有兩個方向相同的轉座子拷貝，并由原復制子隔開。
